В 1945 г. при ЛФИ организуется химико-технологический факультет. В 1949 г. институту присвоено наименование "Ленинградский химико-фармацевтический институт", он специализирован как высшее учебное заведение для подготовки инженеров-химиков-технологов и инженеров-микробиологов для химико-фармацевтических заводов и заводов по производству антибиотиков.
В 1952 г. в институте организован отдел научно-исследовательских работ (ОНИР) для выполнения хоздоговорных научно-исследовательских работ. С сентября 1957 г. в составе института имеется научно-исследовательская лаборатория лекарственных препаратов (НИЛ). В 1958 г. открыто заочное отделение подготовки провизоров при фармацевтическом факультете.
В 1960 г. в институте организован факультет усовершенствования провизоров и инженерно-технических работников медицинской промышленности.
С января 1965 г. институту предоставлено право принимать к защите докторские диссертации, присуждать ученую степень доктора фармацевтических, биологических, химических наук. В 1990 г. ЛХФИ переименован в СПХФИ. А 24 апреля 1996 г. приказом Министерства здравоохранения и медицинской промышленности РФ СПХФИ переименован в СПХФА (Санкт-Петербургскую государственную химико-фармацевтическую академию).В разное время в университете трудились крупнейшие российские ученые А. Е. Ферсман, С. И. Златогоров, Ю. А. Филипченко, Б. И. Словцов, А. А. Владимиров, Л. М. Горовиц-Власова, Ю. С. Залькинд, С. В. Аничков, В. М. Карасик, В. Н. Любименко, А. А. Лихачев, Г. В. Шор, Н. М. Книпович, М. А. Ракузин, Н. Н. Ефремов, И. А. Обергард, А. Ф. Гаммерман, В. П. Ильинский, А. А. Гринберг, Ф. А. Сацыперов, П. Н. Кашкин, Г. Я. Коган, И. А. Муравьев, А. М. Халецкий, И. Ф. Сукневич, Д. А. Зильбер, П. А. Якимов, Н. П. Елинов.
С 1949 года университет подготовил специалистов более чем для 30 государств мира (без учета бывших республик СССР). Выпускники университета успешно трудятся во многих странах Европы, Азии, Африки и Латинской Америки.